Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcnt4E9Q649 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcnt4E9Q649 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcnt4E9Q649 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gcnt4E9Q649 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcnt4E9Q649 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcnt4E9Q649 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcnt4E9Q649 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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