Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
8030474K03RikE9Q4Y8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
8030474K03RikE9Q4Y8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms