Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc4E9Q236 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc4E9Q236 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc4E9Q236 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc4E9Q236 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc4E9Q236 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc4E9Q236 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc4E9Q236 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc4E9Q236 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc4E9Q236 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Abcc4E9Q236 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc4E9Q236 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms