Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfp558E9Q1J0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Zfp558E9Q1J0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp558E9Q1J0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp558E9Q1J0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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