Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0P0

Gm8127, Predicted gene 8127, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8127E9Q0P0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8127E9Q0P0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm8127E9Q0P0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm8127E9Q0P0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169 ms