Protein–RNA interactions for Protein: E9Q069

Vmn1r157, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r157E9Q069 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vmn1r157E9Q069 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r157E9Q069 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r157E9Q069 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r157E9Q069 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms