Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc175E9PVB3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc175E9PVB3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc175E9PVB3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc175E9PVB3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms