Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
5430403G16RikD3Z5L4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
5430403G16RikD3Z5L4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
5430403G16RikD3Z5L4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms