Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nlrc5C3VPR6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrc5C3VPR6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrc5C3VPR6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrc5C3VPR6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms