Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Mfap1bC0HKD9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mfap1bC0HKD9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mfap1bC0HKD9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mfap1bC0HKD9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mfap1bC0HKD9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mfap1bC0HKD9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mfap1bC0HKD9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mfap1bC0HKD9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mfap1bC0HKD9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mfap1bC0HKD9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mfap1bC0HKD9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Mfap1bC0HKD9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mfap1bC0HKD9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mfap1bC0HKD9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mfap1bC0HKD9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mfap1bC0HKD9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mfap1bC0HKD9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mfap1bC0HKD9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mfap1bC0HKD9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mfap1bC0HKD9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mfap1bC0HKD9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms