Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam71aB7XG49 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam71aB7XG49 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam71aB7XG49 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fam71aB7XG49 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam71aB7XG49 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms