Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rd3lB2RV38 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rd3lB2RV38 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rd3lB2RV38 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms