Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Apol7aB2RT54 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apol7aB2RT54 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apol7aB2RT54 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apol7aB2RT54 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apol7aB2RT54 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms