Protein–RNA interactions for Protein: B2RT44

Lonrf2, LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf2B2RT44 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf2B2RT44 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lonrf2B2RT44 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lonrf2B2RT44 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lonrf2B2RT44 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lonrf2B2RT44 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lonrf2B2RT44 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms