Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfc3h1B2RT41 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfc3h1B2RT41 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfc3h1B2RT41 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfc3h1B2RT41 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfc3h1B2RT41 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfc3h1B2RT41 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfc3h1B2RT41 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfc3h1B2RT41 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfc3h1B2RT41 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfc3h1B2RT41 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfc3h1B2RT41 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zfc3h1B2RT41 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfc3h1B2RT41 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfc3h1B2RT41 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfc3h1B2RT41 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfc3h1B2RT41 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfc3h1B2RT41 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfc3h1B2RT41 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfc3h1B2RT41 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfc3h1B2RT41 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfc3h1B2RT41 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfc3h1B2RT41 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfc3h1B2RT41 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfc3h1B2RT41 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms