Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
JrklB2RRL2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
JrklB2RRL2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
JrklB2RRL2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JrklB2RRL2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
JrklB2RRL2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JrklB2RRL2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
JrklB2RRL2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JrklB2RRL2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JrklB2RRL2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JrklB2RRL2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JrklB2RRL2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JrklB2RRL2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms