Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Brpf1B2RRD7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Brpf1B2RRD7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brpf1B2RRD7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brpf1B2RRD7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brpf1B2RRD7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms