Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf3B2RQG2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf3B2RQG2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf3B2RQG2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf3B2RQG2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms