Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
NhsB1AV60 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NhsB1AV60 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NhsB1AV60 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
NhsB1AV60 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NhsB1AV60 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NhsB1AV60 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NhsB1AV60 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NhsB1AV60 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NhsB1AV60 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NhsB1AV60 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NhsB1AV60 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
NhsB1AV60 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
NhsB1AV60 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NhsB1AV60 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NhsB1AV60 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NhsB1AV60 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NhsB1AV60 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NhsB1AV60 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NhsB1AV60 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NhsB1AV60 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NhsB1AV60 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NhsB1AV60 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms