Protein–RNA interactions for Protein: B1ASQ7

Gm13212, Predicted gene 13212, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13212B1ASQ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm13212B1ASQ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm13212B1ASQ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm13212B1ASQ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm13212B1ASQ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm13212B1ASQ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm13212B1ASQ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm13212B1ASQ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm13212B1ASQ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm13212B1ASQ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm13212B1ASQ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms