Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprsB0V2N1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprsB0V2N1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprsB0V2N1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprsB0V2N1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprsB0V2N1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprsB0V2N1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprsB0V2N1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprsB0V2N1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.2 ms