Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1V5

Vwa5b1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b1A9Z1V5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vwa5b1A9Z1V5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vwa5b1A9Z1V5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vwa5b1A9Z1V5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vwa5b1A9Z1V5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vwa5b1A9Z1V5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vwa5b1A9Z1V5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vwa5b1A9Z1V5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa5b1A9Z1V5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa5b1A9Z1V5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa5b1A9Z1V5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa5b1A9Z1V5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vwa5b1A9Z1V5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vwa5b1A9Z1V5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa5b1A9Z1V5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vwa5b1A9Z1V5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa5b1A9Z1V5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms