Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttll11A4Q9F4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttll11A4Q9F4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttll11A4Q9F4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttll11A4Q9F4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms