Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rhox3fA2ANE1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhox3fA2ANE1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhox3fA2ANE1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rhox3fA2ANE1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rhox3fA2ANE1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms