Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhbdl2A2AGA4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhbdl2A2AGA4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhbdl2A2AGA4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhbdl2A2AGA4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms