Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem185aA2AF53 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem185aA2AF53 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem185aA2AF53 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem185aA2AF53 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms