Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd5A2A8L1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chd5A2A8L1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chd5A2A8L1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chd5A2A8L1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chd5A2A8L1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd5A2A8L1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd5A2A8L1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd5A2A8L1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chd5A2A8L1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms