Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smurf2A2A5Z6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smurf2A2A5Z6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smurf2A2A5Z6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smurf2A2A5Z6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smurf2A2A5Z6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smurf2A2A5Z6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smurf2A2A5Z6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smurf2A2A5Z6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smurf2A2A5Z6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smurf2A2A5Z6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smurf2A2A5Z6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smurf2A2A5Z6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smurf2A2A5Z6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf2A2A5Z6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smurf2A2A5Z6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smurf2A2A5Z6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smurf2A2A5Z6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smurf2A2A5Z6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms