Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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