Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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Trbv21A0A0A6YX06 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Trbv21A0A0A6YX06 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Trbv21A0A0A6YX06 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv21A0A0A6YX06 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Trbv21A0A0A6YX06 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Trbv21A0A0A6YX06 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Trbv21A0A0A6YX06 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbv21A0A0A6YX06 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Trbv21A0A0A6YX06 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Trbv21A0A0A6YX06 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Trbv21A0A0A6YX06 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv21A0A0A6YX06 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv21A0A0A6YX06 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv21A0A0A6YX06 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trbv21A0A0A6YX06 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Trbv21A0A0A6YX06 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Trbv21A0A0A6YX06 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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