Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVX8

Ighv5-2, Immunoglobulin heavy variable 5-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,61
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,82■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18,8■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,79■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,79■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,78■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18,78■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18,77■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,77■□□□□ 0,6
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18,77■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18,76■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,75■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18,74■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,74■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18,73■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18,72■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18,72■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18,7■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18,68■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18,67■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,66■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18,65■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,65■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18,65■□□□□ 0,58
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,64■□□□□ 0,57
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18,64■□□□□ 0,57
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,63■□□□□ 0,57
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,63■□□□□ 0,57
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18,63■□□□□ 0,57
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,63■□□□□ 0,57
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,63■□□□□ 0,57
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