RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	GALNT3	Q14435	633 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	ZNF534	Q76KX8	674 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	TMEM209	Q96SK2	561 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	GPR21	Q99679	349 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	FZD10	Q9ULW2	581 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	DOCK1	Q14185	1865 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	ZNF197	O14709	1029 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	CDK14	O94921	469 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	G6PD	P11413	515 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	KCNA5	P22460	613 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	SP2	Q02086	613 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	CDK5R2	Q13319	367 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	NFE2L1	Q14494	772 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	SYVN1	Q86TM6	617 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	DFNA5	O60443	496 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	TLR5	O60602	858 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	PNPLA4	P41247	253 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	RORC	P51449	518 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	BLVRA	P53004	296 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	HMGCS1	Q01581	520 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	NOTUM	Q6P988	496 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	OR2T29	Q8NH02	315 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	RTP4	Q96DX8	246 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	RDH12	Q96NR8	316 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	SEMA3C	Q99985	751 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	TNFRSF11B	O00300	401 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	HCRT	O43612	131 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	B3GAT3	O94766	335 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	POMC	P01189	267 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	HOXD10	P28358	340 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	MAPK1	P28482	360 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	PCSK1	P29120	753 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	PNCK	Q6P2M8	343 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	UNC93A	Q86WB7	457 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	AP3S1	Q92572	193 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	TXNDC15	Q96J42	360 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	IL4R	P24394	825 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	ACLY	P53396	1101 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	CDH12	P55289	794 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	CES5A	Q6NT32	575 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	DOK6	Q6PKX4	331 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	TMEM199	Q8N511	208 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	GTF2H4	Q92759	462 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PXN-222	ENST00000637624	EXOC2	Q96KP1	924 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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