RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CD320Q9NPF0 282 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RREB1Q92766 1687 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL33A6NCF5 533 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 HCRTO43612 131 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 DLX3O60479 287 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINA1P01009 418 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TYRP14679 529 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CREB1P16220 341 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00471Q8N535 108 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TSPEARQ8WU66 669 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RAB7BQ96AH8 199 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CIB1Q99828 191 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.34□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OR51F1A6NGY5 319 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MCIDASD6RGH6 385 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 IQCF3P0C7M6 154 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 EML3Q32P44 896 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TXNDC8Q6A555 127 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FAM129CQ86XR2 697 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SMYD1Q8NB12 490 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OR10A6Q8NH74 314 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC58Q96CX6 371 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RAD9AQ99638 391 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CD244Q9BZW8 370 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MYH11P35749 1972 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MANBAO00462 879 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PGM3O95394 542 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MPIP34949 423 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 IGFALSP35858 605 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CRISP3P54108 245 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GPR107Q5VW38 600 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FRG2Q64ET8 278 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC66Q68CR7 880 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM63Q969Q1 353 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SHDQ96IW2 340 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FRG2BQ96QU4 278 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ABCA3Q99758 1704 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CAPN8A6NHC0 703 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PRMT3O60678 531 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ALPPP05187 535 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CYP4B1P13584 511 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TOMM20Q15388 145 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 DNASE1L2Q92874 299 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 EBF4Q9BQW3 602 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 IL23AQ9NPF7 189 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TYROBPO43914 113 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LAMP2P13473 410 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CPN2P22792 545 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 EMX2Q04743 252 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SCARB2Q14108 478 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RTL4Q6ZR62 310 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.33□□□□□ -1.4
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