RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMB4P28070 264 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC22Q8N4W6 341 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP10Q96AY3 582 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 NACC2Q96BF6 587 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 LHPPQ9H008 270 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC22A11Q9NSA0 550 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 OLAHQ9NV23 265 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 POLG2Q9UHN1 485 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ADRA1AP35348 466 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 RBBP7Q16576 425 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBB8Q3ZCM7 444 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SYTL3Q4VX76 610 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 IGFL2Q6UWQ7 119 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00696Q6ZRV3 163 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 MICALCLQ6ZW33 695 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8K1Q8NGG5 319 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 EURLQ9NYK6 297 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6C2Q9NZP2 312 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GX78 115 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 MACROD2A1Z1Q3 448 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SOCS6O14544 535 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 STSP08842 583 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 GSTM1P09488 218 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS56P0CW18 603 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 GRNP28799 593 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 GSTM4Q03013 218 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM20CQ8IXL6 584 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D21Q8IYX1 336 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 BCORP1Q8N888 145 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ELMO1Q92556 727 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS50Q96JG6 964 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC42Q96M95 316 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 HEMGNQ9BXL5 484 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC78A2IDD5 438 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM1AO60341 852 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 JRKO75564 520 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ARSFP54793 590 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC5A12Q1EHB4 618 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 OVCH1Q7RTY7 1134 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TBL1YQ9BQ87 522 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL20Q9Y2M5 609 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 HEATR9A2RTY3 570 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 STK10O94804 968 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TPM3P06753 285 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGP20916 626 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SPARCL1Q14515 664 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 NKG7Q16617 165 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 FCRL6Q6DN72 434 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 KIRREL2Q6UWL6 708 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ISLR2Q6UXK2 745 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 DENND1AQ8TEH3 1009 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC45Q96CN5 670 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC7Q99615 494 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SLX1AQ9BQ83 275 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR54Q9H977 334 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 AP2A2O94973 939 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNK10P57789 538 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DS3Q14952 304 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 DBN1Q16643 649 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 NAPRTQ6XQN6 538 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TMTC1Q8IUR5 882 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 RCOR2Q8IZ40 523 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 CATSPER1Q8NEC5 780 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1N1Q8NGS0 311 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5K2Q8NHB8 316 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SPSB2Q99619 263 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 CHP1Q99653 195 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLPH3Q9H4A6 298 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 FER1L5A0AVI2 2057 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 AP2A1O95782 977 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ALBP02768 609 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 FTH1P02794 183 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGAXP20702 1163 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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