RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625444.1

PSMD5-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 5, human

TSL 5 BASIC

Gene PSMD5, Length 219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD5-208	ENST00000625444	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	SYVN1	Q86TM6	617 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	TEX19	Q8NA77	164 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	THAP4	Q8WY91	577 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	LRFN5	Q96NI6	719 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	IL17F	Q96PD4	163 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	KIFC1	Q9BW19	673 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	SNX7	Q9UNH6	387 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	CDYL	Q9Y232	598 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444		A0A0J9YY10	115 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	RFPL1	O75677	317 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	SLCO2B1	O94956	709 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	CTSB	P07858	339 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	CBSL	P0DN79	551 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	RORA	P35398	523 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	CBS	P35520	551 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	IL10RA	Q13651	578 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	TMED2	Q15363	201 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	IGFBP7	Q16270	282 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	KYNU	Q16719	465 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	CASC4	Q6P4E1	433 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	TTC23L	Q6PF05	361 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	FAM136A	Q96C01	138 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	PANX3	Q96QZ0	392 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	TCFL5	Q9UL49	500 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	SEC16A	O15027	2179 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	RPN2	P04844	631 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	CAPN1	P07384	714 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	HBQ1	P09105	142 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	TPSB2	P20231	275 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	CHRM3	P20309	590 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	CD9	P21926	228 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	ALAS2	P22557	587 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	GRIA3	P42263	894 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	RAB28	P51157	221 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	PMS2	P54278	862 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	CDK16	Q00536	496 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	KLRB1	Q12918	225 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	KIR2DS3	Q14952	304 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	PBK	Q96KB5	322 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	ING2	Q9H160	280 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	EPN3	Q9H201	632 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	P2RY12	Q9H244	342 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	SOX13	Q9UN79	622 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444	NFS1	Q9Y697	457 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PSMD5-208	ENST00000625444		A6NL46	340 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444		C9J4A7	227 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	KPNA5	O15131	536 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	MSL3P1	P0C860	447 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	ARNT	P27540	789 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	PKLR	P30613	574 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	CASR	P41180	1078 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	GABRA4	P48169	554 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	GRB7	Q14451	532 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	KCNJ11	Q14654	390 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	CPZ	Q66K79	652 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	LRRC6	Q86X45	466 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	MPP5	Q8N3R9	675 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PSMD5-208	ENST00000625444	FOPNL	Q96NB1	174 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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