RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623316.1

ATRX-210, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-210ENST00000623316 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PSD3Q9NYI0 1048 aa5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 THEGQ9P2T0 379 aa5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 UTS2RQ9UKP6 389 aa5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 RAP2CQ9Y3L5 183 aa5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 NLRC5Q86WI3 1866 aa5.91□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TCHHQ07283 1943 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 URADA6NGE7 173 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CASTOR2A6NHX0 329 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 FOXO6A8MYZ6 492 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 H3BQ06 376 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 UGDHO60701 494 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 GPC4O75487 556 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 GCNT3O95395 438 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 WNT1P04628 370 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CCDC175P0C221 793 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CXCL8P10145 99 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 UNGP13051 313 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ETFAP13804 333 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SCP2P22307 547 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SYKP43405 635 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ACOT2P49753 483 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ASIC1P78348 528 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SORDQ00796 357 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CAMK2DQ13557 499 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PTPN14Q15678 1187 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 DUSP6Q16828 381 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 UPP1Q16831 310 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 USP41Q3LFD5 358 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 XP32Q5T750 250 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 FUT10Q6P4F1 479 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CCDC65Q8IXS2 484 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 LRRC57Q8N9N7 239 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 KIAA0895Q8NCT3 520 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 OR14L1PQ8NHC6 308 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 HUS1BQ8NHY5 278 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 FBXL8Q96CD0 374 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 B3GALT6Q96L58 329 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 GBP5Q96PP8 586 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ACCSQ96QU6 501 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CBWD1Q9BRT8 395 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 OPA3Q9H6K4 179 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 TLE6Q9H808 572 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 MAGEF1Q9HAY2 307 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ASB6Q9NWX5 421 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 NDRG3Q9UGV2 375 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 GTF3C4Q9UKN8 822 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 ADAM28Q9UKQ2 775 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 COG5Q9UP83 839 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 CEPT1Q9Y6K0 416 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.9□□□□□ -1.46
ATRX-210ENST00000623316 GOLGA8IPA6NC78 632 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 GOLGA8JA6NMD2 632 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 PPEF2O14830 753 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 TEX28O15482 410 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ADAM12O43184 909 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 TFPIP10646 304 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 KCNA5P22460 613 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 BRCC3P46736 316 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CACNA2D1P54289 1103 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 RBP5P82980 135 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ALCAMQ13740 583 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 LEXMQ3ZCV2 418 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CDONQ4KMG0 1287 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ESCO2Q56NI9 601 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 KRBOX4Q5JUW0 171 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa5.89□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 SLC35F3Q8IY50 421 aa5.89□□□□□ -1.47
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