RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 GALNTL6Q49A17 601 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM74Q86UV6 250 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDIASQ8IXT1 998 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGAP24Q8N264 748 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLA2G15Q8NCC3 412 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 FOXJ1Q92949 421 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 TIMM29Q9BSF4 260 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 APOOQ9BUR5 198 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 IPPKQ9H8X2 491 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC12A4Q9UP95 1085 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 DMTF1Q9Y222 760 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CAPN7Q9Y6W3 813 aa16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACACBO00763 2458 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 EBLN1P0CF75 366 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 HGFP14210 728 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCSK2P16519 638 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRDX6P30041 224 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARRB2P32121 409 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSPA7P48741 367 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCR5P51681 352 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA1024LP59773 190 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CACNA1BQ00975 2339 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHKG1Q16816 387 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 STPG1Q5TH74 334 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 KANK2Q63ZY3 851 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM92Q6UXU6 159 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 LPCAT2Q7L5N7 544 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 OXR1Q8N573 874 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 SNX31Q8N9S9 440 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLHL29Q96CT2 875 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 C19orf60Q96EN9 201 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 EBF4Q9BQW3 602 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CD248Q9HCU0 757 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 TAGLN3Q9UI15 199 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 MOSPD1Q9UJG1 213 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF195O14628 629 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC31A1O15431 190 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 WDR47O94967 919 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 IGLV3-19P01714 112 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT6AP02538 564 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT6BP04259 564 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCND1P24385 295 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCR10P46092 362 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 SCTRP47872 440 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT6CP48668 564 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 AGTR2P50052 363 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 THOP1P52888 689 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CORO7P57737 925 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 SH3BP2P78314 561 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 MXRA7P84157 204 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTK2BQ14289 1009 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 METTL6Q8TCB7 284 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 NAT14Q8WUY8 206 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 TWIST2Q8WVJ9 160 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLK6Q92876 244 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 TCEAL3Q969E4 200 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 NTMT1Q9BV86 223 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 NMUR2Q9GZQ4 415 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC6A17Q9H1V8 727 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNAJC11Q9NVH1 559 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRPS1Q9UHF7 1281 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLGNO14967 610 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBDO15205 165 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 NDUFS2O75306 463 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLDN9O95484 217 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 TSPAN8P19075 237 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 IDSP22304 550 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 EPHA3P29320 983 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PREPP48147 710 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PNLIPRP1P54315 467 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 BTKQ06187 659 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPATA19Q7Z5L4 167 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCED1AQ9H1Q7 454 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACTR8Q9H981 624 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACSS2Q9NR19 701 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 SNX6Q9UNH7 406 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC3-210ENST00000617904 INVSQ9Y283 1065 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms