RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586541.5

PRKAR1A-212, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene PRKAR1A, Length 570 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-212ENST00000586541 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 ASCL5Q7RTU5 278 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 PID1Q7Z2X4 250 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 DHDDSQ86SQ9 333 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 LINC00523Q86TU6 105 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 TAC4Q86UU9 113 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 LCA5Q86VQ0 697 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 DENND1CQ8IV53 801 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 ATPAF2Q8N5M1 289 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF781Q8N8C0 355 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZMIZ2Q8NF64 920 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 UCMAQ8WVF2 138 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 IRGQQ8WZA9 623 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 ST8SIA2Q92186 375 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 MYLPFQ96A32 169 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 CLDN23Q96B33 292 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 CMTM5Q96DZ9 223 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 PCED1BQ96HM7 432 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 LOXL4Q96JB6 756 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 TSNARE1Q96NA8 513 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 AGAP3Q96P47 875 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 PGLYRP2Q96PD5 576 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 TSGA13Q96PP4 275 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 AGAP2Q99490 1192 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 GPR22Q99680 433 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 ECSITQ9BQ95 431 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 CLSTN3Q9BQT9 956 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 TRIM62Q9BVG3 475 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 VCXQ9H320 206 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 VCX3BQ9H321 246 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 RHOJQ9H4E5 214 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 PNPOQ9NVS9 261 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 MIOSQ9NXC5 875 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 CDH9Q9ULB4 789 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 NEU3Q9UQ49 428 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 POLHQ9Y253 713 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZZEF1O43149 2961 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 LAMA5O15230 3695 aa5.51□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 USP24Q9UPU5 2620 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 PI4KAP42356 2102 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 CACNA1BQ00975 2339 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 DPPA5A6NC42 116 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 MAGEA13PA6NCF6 341 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 B5MCH6 92 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 E9PBE3 544 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC22A2O15244 555 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 IRAK2O43187 625 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 BUD23O43709 281 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZBTB14O43829 449 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 KLHL41O60662 606 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 PDE5AO76074 875 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 F9P00740 461 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 URODP06132 367 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 C2P06681 752 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 F7P08709 466 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 COX4I1P13073 169 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 HK1P19367 917 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 HTR1BP28222 390 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 NMBRP28336 390 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 CRABP2P29373 138 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 HOXC13P31276 330 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 HTR7P34969 479 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 NPY2RP49146 381 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 CXCR3P49682 368 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 CACNA2D1P54289 1103 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 CLRN1P58418 232 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 RAP2BP61225 183 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC25A3Q00325 362 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 HHEXQ03014 270 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 KLF10Q13118 480 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 CCNIQ14094 377 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 HERC3Q15034 1050 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 DLG2Q15700 870 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 UPP1Q16831 310 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 UGP2Q16851 508 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 CERCAMQ5T4B2 595 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 MANEALQ5VSG8 457 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 LIPMQ5VYY2 423 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 TMEM154Q6P9G4 183 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKAR1A-212ENST00000586541 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms