RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TAC4	Q86UU9	113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ASB8	Q9H765	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772		H3BQV1	296 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TULP2	O00295	520 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	AQP7	O14520	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SUSD5	O60279	629 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SNX2	O60749	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NDUFS7	O75251	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	UGT1A1	P22309	533 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CDKN1A	P38936	164 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GABRB2	P47870	512 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF75D	P51815	510 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	IQCB1	Q15051	598 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	C8orf44	Q96CB5	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PRR14	Q9BWN1	585 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RCCD1	A6NED2	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	EPHB6	O15197	1021 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SSX4	O60224	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	OR2B3	O76000	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FAM13A	O94988	1023 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TSPAN15	O95858	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TGM6	O95932	706 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	IGSF6	O95976	241 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SOD3	P08294	240 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SLC2A3	P11169	496 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ACP5	P13686	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PCMT1	P22061	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CCR1	P32246	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GABRA4	P48169	554 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	LRMP	Q12912	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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