RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MAML1	Q92585	1016 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NUS1	Q96E22	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	BMF	Q96LC9	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FRYL	O94915	3013 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PR77	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	AREL1	O15033	823 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LAT	O43561	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SOCS5	O75159	536 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	USP12	O75317	370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ANXA9	O76027	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NDST3	O95803	873 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GAS8	O95995	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FGG	P02679	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ANXA6	P08133	673 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MMP2	P08253	660 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ADRB1	P08588	477 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CD59	P13987	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ETS1	P14921	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TPH1	P17752	444 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PSMB4	P28070	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MMP12	P39900	470 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GNPDA1	P46926	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	POLD2	P49005	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LIMK1	P53667	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GEM	P55040	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NXPH1	P58417	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GNG11	P61952	73 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CNGA3	Q16281	694 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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