RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542557.5

PTPRO-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 2,946 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-208ENST00000542557 GRM6O15303 877 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 GPR42O15529 346 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 RETP07949 1114 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 C1SP09871 688 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 CTSAP10619 480 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 PRPS2P11908 318 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 AOAHP28039 575 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 CCR7P32248 378 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRO-208ENST00000542557 ARHGEF7Q14155 803 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRO-208ENST00000542557 ASB11Q8WXH4 323 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRO-208ENST00000542557 ACTR8Q9H981 624 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRO-208ENST00000542557 ALBP02768 609 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 HIST1H2ADP20671 130 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 CYP2A7P20853 494 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 NFKBIAP25963 317 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 PCSK6P29122 969 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 HLCSP50747 726 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRO-208ENST00000542557 CDH15P55291 814 aa6.39□□□□□ -1.39
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