RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532181.5

SSH3-208, Transcript of slingshot protein phosphatase 3, human

TSL 3

Gene SSH3, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSH3-208	ENST00000532181	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	HMX2	A2RU54	273 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	C9orf172	C9J069	976 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	NDC80	O14777	642 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	HCRTR1	O43613	425 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	JMJD7	P0C870	316 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	PVR	P15151	417 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	NDUFS1	P28331	727 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	SEPHS1	P49903	392 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	TMPRSS3	P57727	454 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	KRT33B	Q14525	404 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	KCNAB1	Q14722	419 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ZIC1	Q15915	447 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	TRIM73	Q86UV7	250 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	RELL1	Q8IUW5	271 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	GPATCH11	Q8N954	259 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ASB11	Q8WXH4	323 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	USP7	Q93009	1102 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	OR2A14	Q96R47	310 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	DPH1	Q9BZG8	443 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ZFAT	Q9P243	1243 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	VWA7	Q9Y334	891 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181		A0A1W2PPV9	198 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181		E5RI56	91 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	GFY	I3L273	518 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	KPNA5	O15131	536 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	EFS	O43281	561 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	C1QL1	O75973	258 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	CTSB	P07858	339 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	FOLR1	P15328	257 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ATP5D	P30049	168 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	PKLR	P30613	574 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	TMED2	Q15363	201 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	VPS39	Q96JC1	886 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	PKP4	Q99569	1192 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	CTRC	Q99895	268 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	POMT2	Q9UKY4	750 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	MGA	Q8IWI9	3026 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	EFCAB7	A8K855	629 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	PFDN6	O15212	129 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	NRP2	O60462	931 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	VPS26A	O75436	327 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	GSTA2	P09210	222 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	ST6GAL1	P15907	406 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	UGT2B7	P16662	529 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	SAT1	P21673	171 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SSH3-208	ENST00000532181	CD9	P21926	228 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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