RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 COMMD8Q9NX08 183 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 ATRXP46100 2492 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM8BA6NDV4 472 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 C15orf61A6NNL5 157 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 MPTX1A8MV57 137 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 FAM25EA8MYX2 175 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 MELTFP08582 738 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 FOLR2P14207 255 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 PRKACGP22612 351 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 PAX7P23759 505 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 MTHFRP42898 656 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 RXRGP48443 463 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 MPP1Q00013 466 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 PTPN14Q15678 1187 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 CCNG2Q16589 344 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 PARP10Q53GL7 1025 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 ARMC3Q5W041 872 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 MZT2BQ6NZ67 158 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 C16orf87Q6PH81 154 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 ARL10Q8N8L6 244 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 AQP11Q8NBQ7 271 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 HTRA1Q92743 480 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 ATP6V1E2Q96A05 226 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 SGK494Q96LW2 274 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 SPAG5Q96R06 1193 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 SERINC2Q96SA4 455 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 MAP7D2Q96T17 732 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 TSPYL1Q9H0U9 437 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 GNB4Q9HAV0 340 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 SH3GLB2Q9NR46 395 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 SUN2Q9UH99 717 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 A0A1W2PN81 502 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 A0A1W2PQF6 199 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 ERICH4A6NGS2 130 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 E9PI62 339 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 K7ENM7 598 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 TMCC2O75069 709 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 SEC14L2O76054 403 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 GP9P14770 177 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 CHRNA7P36544 502 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM50BP56557 158 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 LRMPQ12912 555 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 GAGE2BQ13066 116 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 GAGE2EQ4V326 116 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 GCNT6Q5T4J0 391 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 OR8H2Q8N162 312 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 APPL2Q8NEU8 664 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 RMDN2Q96LZ7 410 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 ABHD6Q9BV23 337 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 SLC26A6Q9BXS9 759 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 PDCL3Q9H2J4 239 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 DCAF16Q9NXF7 216 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 PCSK1NQ9UHG2 260 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 RABL2BQ9UNT1 228 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 IL16Q14005 1332 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 PIK3R4Q99570 1358 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 ASB14A6NK59 587 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 A6NLC8 198 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 B4E171 279 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 TGFB1I1O43294 461 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 HCRTR2O43614 444 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 E2F6O75461 281 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 MBD4O95243 580 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 TPM3P06753 285 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 CA6P23280 308 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 IL4RP24394 825 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 HLCSP50747 726 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 SARNPP82979 210 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 PLA2G7Q13093 441 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 FILIP1LQ4L180 1135 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 FAAH2Q6GMR7 532 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-220ENST00000531466 MAATS1Q7Z4T9 603 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89 ms