RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524226.5

PCM1-222, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCM1, Length 5,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-222	ENST00000524226	TNF	P01375	233 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CD2	P06729	351 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GIMD1	P0DJR0	217 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	NR2F1	P10589	423 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	COL6A2	P12110	1019 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	IGFALS	P35858	605 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	WAS	P42768	502 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GLRB	P48167	497 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GSS	P48637	474 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GATM	P50440	423 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ERF	P50548	548 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CCR4	P51679	360 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	TMBIM6	P55061	237 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CAP1	Q01518	475 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	DUSP4	Q13115	394 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GPR17	Q13304	367 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	BMPR2	Q13873	1038 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	MPP2	Q14168	576 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ACAP2	Q15057	778 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RHEB	Q15382	184 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	USP53	Q70EK8	1073 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	DEFB119	Q8N690	84 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	NAT16	Q8N8M0	369 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	C17orf50	Q8WW18	174 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CERS2	Q96G23	380 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	MED8	Q96G25	268 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SLC38A3	Q99624	504 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	POMK	Q9H5K3	350 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	HHATL	Q9HCP6	504 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	MCUB	Q9NWR8	336 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	DHRS12	A0PJE2	317 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	TPP1	O14773	563 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	HDAC3	O15379	428 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PLOD3	O60568	738 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	TBL1X	O60907	577 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	TULP3	O75386	442 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	TIPRL	O75663	272 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	UGT2B17	O75795	530 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ZNF432	O94892	652 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ITGB1	P05556	798 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GALT	P07902	379 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	FGFR3	P22607	806 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	IL4R	P24394	825 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PRDX6	P30041	224 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SOX11	P35716	441 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CRAT	P43155	626 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	NME5	P56597	212 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PER3	P56645	1201 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PPP3R1	P63098	170 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	FAM189B	P81408	668 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ARF5	P84085	180 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	MC1R	Q01726	317 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	DSC1	Q08554	894 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	LAPTM5	Q13571	262 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GRM2	Q14416	872 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	MSS51	Q4VC12	460 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		2.54	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		2.54	□□□□□ -2

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