RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511148.2

CLRN2-201, Transcript of clarin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN2, Length 823 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2-201ENST00000511148 CD200R1Q8TD46 325 aa14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 USP7Q93009 1102 aa14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 FMO2Q99518 471 aa14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 MAP3K3Q99759 626 aa14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 ICKQ9UPZ9 632 aa14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 MED16Q9Y2X0 877 aa14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 VWA7Q9Y334 891 aa14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.71□□□□□ -0.05
CLRN2-201ENST00000511148 ESPNB1AK53 854 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 ISM1B1AKI9 464 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 TK2O00142 265 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 MAP3K7O43318 606 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 C1orf105O95561 183 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 CATP04040 527 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 CBSLP0DN79 551 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 CBSP35520 551 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 RAB28P51157 221 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 CDKN2DP55273 166 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 GPX6P59796 221 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 KYNUQ16719 465 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 FBF1Q8TES7 1133 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 UBXN4Q92575 508 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 TAAR9Q96RI9 348 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 CD180Q99467 661 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 PSAT1Q9Y617 370 aa14.7□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 TLCD2A6NGC4 264 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 ZBTB14O43829 449 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 SPAG6O75602 509 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 MATN4O95460 622 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 TPBGLP0DKB5 382 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 MPC1LP0DKB6 136 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 CD9P21926 228 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 SLC5A2P31639 672 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 STX2P32856 288 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 PHBP35232 272 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 SLC12A2P55011 1212 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 GBX1Q14549 363 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 TEX35Q5T0J7 233 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 DCAF12Q5T6F0 453 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 CYS1Q717R9 158 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 PRSS42Q7Z5A4 293 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 PPM1NQ8N819 430 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 IL17FQ96PD4 163 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 CTRCQ99895 268 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 NFU1Q9UMS0 254 aa14.69□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 CACNA1GO43497 2377 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 B4E171 279 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 RASGRF2O14827 1237 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 PRAMEF10O60809 474 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 PKLRP30613 574 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 TSPAN7P41732 249 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 RAB15P59190 212 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 IL2P60568 153 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 SH3BP2P78314 561 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 MC2RQ01718 297 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.68□□□□□ -0.06
CLRN2-201ENST00000511148 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms