RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	COPG2	Q9UBF2	871 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO6	Q9UM54	1294 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FBN2	P35556	2912 aa		10.5	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GUH1	482 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF749	O43361	778 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPN1	P07384	714 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFS1	P28331	727 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CA5A	P35218	305 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	HADHA	P40939	763 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	LMAN1	P49257	510 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GBE1	Q04446	702 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DMPK	Q09013	629 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	AP1B1	Q10567	949 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC16	Q13042	620 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB17	Q13105	803 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DPYSL3	Q14195	570 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZS92	163 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DET1	Q7L5Y6	550 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FJX1	Q86VR8	437 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNMB4	Q86W47	210 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PHC3	Q8NDX5	983 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	INPP5D	Q92835	1189 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	HDAC11	Q96DB2	347 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	AGAP3	Q96P47	875 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF670	Q9BS34	389 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DEF6	Q9H4E7	631 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO1F	O00160	1098 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MATN2	O00339	956 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT1A9	O60656	530 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	POLB	P06746	335 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CD63	P08962	238 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT1A6	P19224	532 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MSH3	P20585	1137 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT1A1	P22309	533 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT1A4	P22310	534 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SPAM1	P38567	509 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSC	P53634	463 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MYL5	Q02045	173 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC9A5	Q14940	896 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PDK2	Q15119	407 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf189	Q5VU69	101 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GRHL3	Q8TE85	626 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	LCN9	Q8WX39	176 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIB3	Q96RU7	358 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	POMT2	Q9UKY4	750 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	F8	P00451	2351 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MASP2	O00187	686 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	AURKA	O14965	403 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PMPCB	O75439	489 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	NDST3	O95803	873 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SKIL	P12757	684 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ST6GAL1	P15907	406 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGA9	Q13797	1035 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		10.47	□□□□□ -0.73

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