RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 ESX1Q8N693 406 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNJ9Q92806 393 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC22A18Q96BI1 424 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 TUBB2BQ9BVA1 445 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 SPRY4Q9C004 299 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB17Q9H0T7 212 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 WHRNQ9P202 907 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 KLHL42Q9P2K6 505 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 GALPQ9UBC7 116 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 CDC23Q9UJX2 597 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 NFS1Q9Y697 457 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 TEX264Q9Y6I9 313 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 VPS26AO75436 327 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 C1orf105O95561 183 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 MT-ND3P03897 115 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 CCNYL3P0C7X3 344 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 UGT2B7P16662 529 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 CD9P21926 228 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 PKLRP30613 574 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 ABHD18Q0P651 414 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 MAP7Q14244 749 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR19Q15760 415 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 KLHL38Q2WGJ6 581 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 ACSBG2Q5FVE4 666 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 KIAA0408Q6ZU52 694 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 OR8K5Q8NH50 307 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 INPP5DQ92835 1189 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 OR2A14Q96R47 310 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 EFHD1Q9BUP0 239 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 PITPNM3Q9BZ71 974 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 KLHL25Q9H0H3 589 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 SPHK1Q9NYA1 384 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 DHRS7Q9Y394 339 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 PCM1Q15154 2024 aa18.64■□□□□ 0.58
SH3BP4-209ENST00000484097 RASGRF2O14827 1237 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 EFSO43281 561 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 DLGAP3O95886 979 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 TUBB4AP04350 444 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 PVRP15151 417 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF28P17035 718 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 BDKRB1P46663 353 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 CLCN7P51798 805 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 GBX1Q14549 363 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 NEK10Q6ZWH5 1172 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXO36Q8NEA4 188 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 OR2L8Q8NGY9 312 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF31Q96EP0 1072 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 IL17FQ96PD4 163 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR21Q99679 349 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 SERTAD3Q9UJW9 196 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0J9YY10 115 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 MATN4O95460 622 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 CATP04040 527 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 RHDQ02161 417 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC5A12Q1EHB4 618 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 STEAP4Q687X5 459 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 DUPD1Q68J44 220 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM73Q86UV7 250 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM126BQ8IUX1 230 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 CNTN4Q8IWV2 1026 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 ZBED8Q8IZ13 594 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 GALNT6Q8NCL4 622 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 TCTN2Q96GX1 697 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM114A2Q9NRY5 505 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 TAS2R13Q9NYV9 303 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 ZZEF1O43149 2961 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM150CB9EJG8 249 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 E7ESA3 106 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 TP73O15350 636 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 SCRG1O75711 98 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 AHSGP02765 367 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 NTRK1P04629 796 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4-209ENST00000484097 MPC1LP0DKB6 136 aa18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms