RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 FOXJ1Q92949 421 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 GLYATL1Q969I3 302 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CLIP3Q96DZ5 547 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 BBS4Q96RK4 519 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 XKR8Q9H6D3 395 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 AHSPQ9NZD4 102 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 NDOR1Q9UHB4 597 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 TRIM38O00635 465 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 FDXRP22570 491 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 C21orf59P57076 290 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 TP53BP2Q13625 1128 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PTGR1Q14914 329 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 TERB1Q8NA31 727 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 GLMNQ92990 594 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SKA1Q96BD8 255 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 RANBP9Q96S59 729 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SDHDO14521 159 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 OR1F1O43749 312 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 G6PDP11413 515 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 C6P13671 934 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CLCN4P51793 760 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 DGKEP52429 567 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 BLMHQ13867 455 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SYVN1Q86TM6 617 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM129CQ86XR2 697 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM74Q96NL1 305 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SPTBN2O15020 2390 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 MGRN1O60291 552 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ALBP02768 609 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 GNAZP19086 355 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 HTR6P50406 440 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PON2Q15165 354 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 KRT78Q8N1N4 520 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 TEX26Q8N6G2 289 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CHFRQ96EP1 664 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SORT1Q99523 831 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 EBF2Q9HAK2 575 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 EURLQ9NYK6 297 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SELENONQ9NZV5 590 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 E7ENX8 843 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PTGES3LE9PB15 166 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP7B1O75881 506 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 EPN2O95208 641 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 LATS1O95835 1130 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ASGR2P07307 311 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF30P17039 623 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 ITGAXP20702 1163 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SSR2P43308 183 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CCT8P50990 548 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 NAA20P61599 178 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 MTX3Q5HYI7 312 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CYP20A1Q6UW02 462 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 MFSD6LQ8IWD5 586 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 OR10A6Q8NH74 314 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CD200R1Q8TD46 325 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 CIB1Q99828 191 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 DGCR6LQ9BY27 220 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 TBX10O75333 385 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRVP-201ENST00000482597 PRLP01236 227 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms