RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA16Q9BXB7 569 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ACPTQ9BZG2 426 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 EBF3Q9H4W6 596 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SLC32A1Q9H598 525 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS16Q9NQE7 514 aa5.51□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 A6NHS1 94 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 AP1G1O43747 822 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A3O75751 556 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 HLA-EP13747 358 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 EPB42P16452 691 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 IL27RAQ6UWB1 636 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 ASZ1Q8WWH4 475 aa5.5□□□□□ -1.53
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