RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460826.1

HDLBP-229, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 442 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-229	ENST00000460826	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	TMEM74	Q96NL1	305 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	PKP4	Q99569	1192 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	RAB33B	Q9H082	229 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	GPAM	Q9HCL2	828 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	GSAP	A4D1B5	854 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	MYO1C	O00159	1063 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	CDC7	O00311	574 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	RASGRF2	O14827	1237 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SHBG	P04278	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	INHBA	P08476	426 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	STMN1	P16949	149 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SHMT2	P34897	504 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	HSD17B3	P37058	310 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	MSH2	P43246	934 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	CSRP3	P50461	194 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	RAB28	P51157	221 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	RAB10	P61026	200 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	PHKG1	Q16816	387 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	TTC23L	Q6PF05	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	KLHL35	Q6PF15	583 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	MAP3K3	Q99759	626 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	PDE10A	Q9Y233	779 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	APC2	O95996	2303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	C8G	P07360	202 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	HGF	P14210	728 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	LSS	P48449	732 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SHC2	P98077	582 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	DLG1	Q12959	904 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	EMB	Q6PCB8	327 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SNX15	Q9NRS6	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	POMT2	Q9UKY4	750 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	ACACA	Q13085	2346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	ACACB	O00763	2458 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826		A0A1W2PPV9	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SLC16A5	O15375	505 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	ZBTB14	O43829	449 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	KDM1A	O60341	852 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	CCDC166	P0CW27	439 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	ERG	P11308	486 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	UGT2B7	P16662	529 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	CYP2A7	P20853	494 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SEPHS1	P49903	392 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SERPINB9	P50453	376 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	IRF9	Q00978	393 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SP140	Q13342	867 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HDLBP-229	ENST00000460826	SBSN	Q6UWP8	590 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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